Fernando Diaz
La selección genómica ha revolucionado los programas genéticos en la industria lechera. El desarrollo de métodos de genotipado de alto rendimiento unido a un menor coste de las pruebas ha hecho que la selección genómica sea muy común en granjas lecheras. Realizar pruebas genómicas en las hembras es una forma efectiva de identificar las mejores novillas de reemplazo, y así, incrementar el mérito genético y la rentabilidad del rebaño.
Usando datos genómicos de 7,508 animales genotipados (158 toros y 7,350 vacas) registrados en Holstein de México, investigadores del INIFAP (García-Ruiz et al., 2019) del Centro Nacional de Investigación en Fisiología y Mejoramiento Animal (Querétaro, México) determinaron la exactitud de la información incluida en el pedigrí de la población de vacas Holstein mejicanas registradas. Los animales nacieron entre 2002 y 2014, y fueron genotipados con polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) de diferentes densidades (200 – 777,000 SNPs).
Debido a que la población de vacas Holstein Méjico deriva principalmente de genética de EEUU y Canadá, en este estudio se usaron los datos genómicos de Holstein de EEUU para verificar el parentesco. Sin embargo, la población Holstein mejicana También emplea material genético procedente de Italia, Francia, Inglaterra, España, Nueva Zelanda y otros países. Por este motivo, un 17 y un 12% de los padres de vacas y toros, respectivamente, no disponía del genotipo paternal para realizar la validación del parentesco.
Sorprendentemente, de las 7,795 pruebas de parentesco, los investigadores encontraron que 777 pruebas fueron erróneas, representando un 10% de los animales testados genómicamente. Para toros, el índice de error en la verificación del parentesco en los padres fue un 5% y en las madres un 3%. Errores de verificación en los padres y en las madres de las vacas fueron encontrados en un 11 y 8% estas, respectivamente. Estos índices de error de parentesco fueron similares a los publicados en otros estudios llevados a cabo en Alemania (7%), Irlanda (7 – 9%), EEUU (11%) e Israel (12%).
En conclusión, este trabajo demuestra que los errores en la identificación del parentesco son comunes en la industria lechera. Estos puedes tener efectos negativos sobre la selección genética, produciendo pérdidas en la mejora genética. Estos errores en el registro de los padres pueden ocurrir en la granja lechera (inseminación, partos), en el centro de inseminación artificial y en los laboratorios de genotipado.
Referencia
García-Ruiz, G. R. Wiggans, and F. J. Ruiz-López. 2019. Pedigree verification and parentage assignment using genomic information in the Mexican Holstein population. J. Dairy Sci. 102:1806–1810.
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